故事发生在工藤新一变成江户川柯南前100天的时候，高中生侦探工藤新一和毛利兰一起前往山里的十五夜村，这个村里自古就有大鸟袭击村民并将其变成饵食的传说3天后村里即将举行安抚大鸟神魂魄的祭祀活动，于是当园子的爸爸的朋友大富豪和仓勇海在百舌鸟翔神社里向大家介绍的时候，一起伪装成大鸟传说的杀人案件发生了帮助研究大鸟传说的和仓的助手小坂被杀，村里的巫师土师登美声称这是诅咒报应接下来和仓的次男凉二也以同样的手法被杀工藤新一即将挑战流传在村里的大鸟传说之谜，同时揭开这个连续杀人事件的真相！