萌学园，传说成立的时间是在地球诞生的年代，是一所由夸克族人组成的魔法学校，隐藏在地球大气层外平行空间里，并由萌骑士幻之星、炎之星、智之星、十之星及月之星，代代相传，守护地球的和平在一次抢救魔法生物的任务中，意外引来宇宙中的黑色力量莫尔斯，威胁萌骑士交出磐古，召唤出萌学园的过去，否则将用魔法抽干地球水资源，让所有生命干涸而死！“磐古”，究竟是什么？为了拯救地球，萌骑士们踏上寻找磐古的旅程，竟发现磐古的神秘力量与自己的魔法有著密不可分的连结，然而要付出什么代价才能阻止莫尔斯夺走磐古？与萌骑士一起面对跟地球共存亡的关键战役！