在首都机能迁移到新都后，被遗忘的城市·东京虽然一部分人留了下来，但是街道仍然在不断荒废，成为了“迷宫～Labyrins～”。同时被人们称作“梦幻事件”的奇怪事件屡屡发生，并且有不断恶化的倾向。拥有神秘力量“神智”的少年侦探兰树，接下了揭开真相的任务。